高级 F2PY 用例#
将用户定义的函数添加到 F2PY 生成的模块#
usercode
用户定义的 Python C/API 函数可以使用和语句在签名文件内定义pymethoddef
(它们必须在块内使用)。例如下面的签名文件python module
spam.pyf
! -*- f90 -*-
python module spam
usercode '''
static char doc_spam_system[] = "Execute a shell command.";
static PyObject *spam_system(PyObject *self, PyObject *args)
{
char *command;
int sts;
if (!PyArg_ParseTuple(args, "s", &command))
return NULL;
sts = system(command);
return Py_BuildValue("i", sts);
}
'''
pymethoddef '''
{"system", spam_system, METH_VARARGS, doc_spam_system},
'''
end python module spam
包装 C 库函数system()
:
f2py -c spam.pyf
在 Python 中,这可以用作:
>>> import spam
>>> status = spam.system('whoami')
pearu
>>> status = spam.system('blah')
sh: line 1: blah: command not found
添加用户定义的变量#
以下示例说明如何通过修改 F2PY 生成模块的字典来将用户定义变量添加到 F2PY 生成的扩展模块。考虑以下签名文件(用 编译):f2py -c var.pyf
! -*- f90 -*-
python module var
usercode '''
int BAR = 5;
'''
interface
usercode '''
PyDict_SetItemString(d,"BAR",PyInt_FromLong(BAR));
'''
end interface
end python module
请注意,第二条usercode
语句必须在块内定义interface
,并且模块字典可通过变量使用d
(请参阅varmodule.c
generated by了解更多详细信息)。f2py var.pyf
Python 中的用法:
>>> import var
>>> var.BAR
5
处理 KIND 说明符#
目前,F2PY 只能处理
其中 是数字整数的声明(例如 1、2、4、…),但不能处理函数调用或任何其他表达式。 F2PY 需要知道相应的 C 类型是什么,而通用的解决方案则太复杂而难以实现。<type spec>(kind=<kindselector>)
<kindselector>
KIND(..)
然而,F2PY 提供了一个钩子来克服这个困难,即用户可以定义自己的 <Fortran type> 到 <C type> 映射。例如,如果 Fortran 90 代码包含:
REAL(kind=KIND(0.0D0)) ...
然后创建一个包含Python字典的映射文件:
{'real': {'KIND(0.0D0)': 'double'}}
例如。
使用--f2cmap
命令行选项将文件名传递给 F2PY。默认情况下,F2PY 假定文件名位于.f2py_f2cmap
当前工作目录中。
更一般地说,f2cmap 文件必须包含一个包含以下项目的字典:
<Fortran typespec> : {<selector_expr>:<C type>}
定义 Fortran 类型之间的映射:
<Fortran typespec>([kind=]<selector_expr>)
以及相应的<C类型>。 <C 类型> 可以是以下之一:
double
float
long_double
char
signed_char
unsigned_char
short
unsigned_short
int
long
long_long
unsigned
complex_float
complex_double
complex_long_double
string
例如,对于func1.f
包含以下内容的 Fortran 文件:
subroutine func1(n, x, res)
use, intrinsic :: iso_fortran_env, only: int64, real64
implicit none
integer(int64), intent(in) :: n
real(real64), intent(in) :: x(n)
real(real64), intent(out) :: res
Cf2py intent(hide) :: n
res = sum(x)
end
为了转换int64
为real64
有效的C
数据类型,.f2py_f2cmap
可以在当前目录中创建包含以下内容的文件:
dict(real=dict(real64='double'), integer=dict(int64='long long'))
并像往常一样创建模块。 F2PY 检查.f2py_f2cmap
当前目录中是否存在文件,并使用它来将说明KIND
符映射到C
数据类型。
f2py -c func1.f -m func1
或者,映射文件可以使用任何其他名称保存,例如
mapfile.txt
,并且可以使用该选项将此信息传递给 F2PY --f2cmap
。
f2py -c func1.f -m func1 --f2cmap mapfile.txt
有关更多信息,请参阅 F2Py 源代码numpy/f2py/capi_maps.py
。
字符串#
假定长度字符串#
在 Fortran 中,假定长度的字符串参数被声明为
character*(*)
or character(len=*)
,也就是说,此类参数的长度由运行时的实际字符串参数决定。对于intent(in)
参数来说,长度信息的缺乏不会给 f2py 构造函数包装函数带来任何问题。然而,对于intent(out)
参数来说,缺乏长度信息对于 f2py 生成的包装器来说是有问题的,因为没有可用于为此类参数创建内存缓冲区的大小信息,并且 F2PY 假定长度为 0。取决于如何指定假定长度字符串的长度,有一些方法可以解决此问题,如下例所示。
如果输出参数的长度character*(*)
由其他输入参数的状态确定,则可以在签名文件或 f2py 注释中通过为相应参数添加额外声明来建立所需的连接,该声明指定字符选择器部分的长度。例如,考虑一个 Fortran 文件asterisk1.f90
:
subroutine foo1(s)
character*(*), intent(out) :: s
!f2py character(f2py_len=12) s
s = "123456789A12"
end subroutine foo1
使用和 然后在 Python 中编译它:f2py -c asterisk1.f90 -m asterisk1
>>> import asterisk1
>>> asterisk1.foo1()
b'123456789A12'
请注意,额外的声明仅由 f2py 解释,并且在规范中可以使用 C 表达式作为长度值。character(f2py_len=12) s
f2py_len=
在以下示例中:
subroutine foo2(s, n)
character(len=*), intent(out) :: s
integer, intent(in) :: n
!f2py character(f2py_len=n), depend(n) :: s
s = "123456789A123456789B"(1:n)
end subroutine foo2
n
在 Python 中,使用 F2PY 包装后,输出假定长度字符串的长度取决于输入参数:
>>> import asterisk
>>> asterisk.foo2(2)
b'12'
>>> asterisk.foo2(12)
b'123456789A12'
>>>